Une nouvelle étude indique une propagation généralisée du SRAS-CoV-2 parmi une population de cerfs sauvages

Plus tôt cette année, des chercheurs ont découvert que plusieurs cerfs sauvages du Michigan avaient des anticorps indiquant cette Animaux exposés au SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19. Cela a été une source de préoccupation majeure, car un grand nombre d’animaux sensibles pourraient servir de réservoir permettant au virus de se propager à l’homme.

Mais à l’époque, le doute régnait. L’étude n’a examiné qu’un petit échantillon de populations de cerfs dans un État – nous ne savions pas comment les animaux étaient exposés, et nous ne savions pas si le virus se propageait réellement parmi les cerfs sauvages. Depuis, quelques blancs ont été remplis. Surtout, la transmission de cerf à cerf a été observée en captivité. Lundi, un Prépresse pour une nouvelle feuille Il a répondu à plus de questions, expliquant que l’infection est répandue dans un deuxième cas, entraînée par sa propagation des humains et sa transmission de cerf à cerf.

En général, les nouvelles ne sont pas particulièrement bonnes, même si nous ne comprenons toujours pas les risques qu’elles peuvent présenter pour l’homme.

chasse aux virus

Il existe encore de nombreuses inconnues sur la propagation du SRAS-CoV-2 aux cerfs, et parmi elles se trouve sa transmission. Nous savons que la transmission aux cerfs est possible, mais nous n’avons pas une idée précise de la fréquence à laquelle le virus passe des humains aux cerfs ou si cela se produit directement ou via une espèce intermédiaire. Une fois infectés, les cerfs présentent des symptômes évidents, mais le virus a une évolution temporelle similaire : il peut être détecté après quatre jours et reste détectable pendant trois semaines après l’infection.

L’équipe comprenait des membres du département des ressources naturelles de l’Iowa qui se sont inspirés des découvertes du Michigan pour voir ce qui se passait dans leur état. Ils se sont associés à divers chercheurs universitaires pour tester à la fois des cerfs sauvages et des cerfs dans des réserves de chasse, dont beaucoup ont été tués par des braconniers ou des voitures. Leur étude a commencé en avril 2020, mais la plupart des 283 échantillons sont venus après le début de la saison de chasse en septembre ; Les choses se sont conclues début janvier 2021.

Dans une certaine mesure, le processus d’échantillonnage a coïncidé avec la trajectoire initiale de l’épidémie dans l’Iowa, qui a connu son premier pic de cas en avril 2020 avant de culminer à la fin de l’année. Enfin, 94 des cerfs (33%) ont été testés positifs au cours de l’étude. Mais ce nombre masque certains changements évidents au fil du temps.

Chez le cerf, au moins, le virus n’a été détecté du tout qu’après le début de la saison de chasse, bien que le taux d’échantillonnage pendant cette période ait été trop faible pour déterminer la signification de cette découverte. Mais le premier cerf positif a été détecté peu de temps après le début de la saison de chasse, et le nombre a considérablement augmenté à mesure que les cas chez l’homme augmentaient. En décembre, plus de 80% des cerfs testés étaient positifs pour le virus.

Comment est-ce arrivé ici?

Les taux d’échantillonnage pendant les mois de la saison de chasse sont restés relativement constants, de sorte que l’augmentation des cas semble réelle. Mais il n’est pas possible de savoir quelle part de la contribution est venue de la présence de chasseurs parmi les cerfs et quelle part est venue de la présence d’un grand nombre d’humains qui ont contracté le virus. La chasse peut également modifier le comportement du cerf de manière à lui permettre de se propager plus facilement.

Pour aider à comprendre ce qui pourrait arriver, l’équipe de recherche a obtenu des séquences génomiques du virus dans tous leurs échantillons, leur permettant de retracer les lignées individuelles du virus et de comparer les virus trouvés chez les cerfs à ceux des humains environnants.

L’équipe de recherche a trouvé des dizaines de souches différentes de SRAS-CoV-2 dans la communauté des cerfs. La plus courante était également la plus courante des souches circulant chez l’homme dans l’Iowa à la même époque. De plus, il y avait quelques similitudes entre les sous-espèces de cerfs et les humains, mais les auteurs préviennent que les résultats représentent un petit échantillon des deux groupes, car le séquençage du génome pour les humains n’était pas courant à l’époque non plus.

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Jacinthe Poulin

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