L’intelligence artificielle a trouvé un ancêtre fantôme inconnu dans le génome humain

Personne ne sait qui elle était, seulement qu’elle était différente : une adolescente d’il y a plus de 50 000 ans avec une si étrange exclusivité semblait être un ancêtre « hybride » des humains modernes que les scientifiques n’avaient jamais vu auparavant.

Ce n’est que récemment que les chercheurs ont découvert des preuves qu’elle n’était pas seule. Dans une étude de 2019 analysant le chaos complexe de la préhistoire humaine, les scientifiques ont utilisé L’intelligence artificielle (IA) pour identifier une espèce inconnue d’hominidés que les humains modernes ont rencontrés – et se sont engagés à caresser – lors du long voyage hors d’Afrique il y a des milliers d’années.

« Il y a environ 80 000 ans, le soi-disant Exode d’Afrique s’est produit, lorsqu’une partie de la population, qui était déjà des humains modernes, a déserté le continent africain et a migré vers d’autres continents, donnant naissance à toutes les populations actuelles. expliquer Le biologiste évolutionniste Jaume Bertranpetit de l’Université Pompeu Fabra en Espagne.

Au fur et à mesure que les humains modernes ont tracé ce chemin sur terre en Eurasie, ils ont également forgé quelques autres choses – se sont croisés avec des humains anciens et éteints d’autres espèces.

Jusqu’à récemment, on pensait que ces partenaires sexuels occasionnels incluaient les Néandertaliens et les Dénisoviens, ce dernier n’étant connu qu’en 2010.

Mais dans cette étude, un troisième ancien a été isolé il y a longtemps dans l’ADN eurasien, grâce à des algorithmes d’apprentissage en profondeur qui scannent un bloc complexe de code génétique humain ancien et moderne.

En utilisant une technique statistique appelée Inférence bayésienneDans l’étude, les chercheurs ont trouvé des preuves de ce qu’ils appellent la “troisième introversion” – un groupe “fantôme” archaïque avec lequel les humains modernes se sont croisés pendant la migration africaine.

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“Ce groupe était soit lié à la lignée des Néandertaliens et des Denisoviens, soit a divergé tôt de la lignée Denisova”, écrit dans son journal, ce qui signifie qu’il est probable que ce troisième groupe dans l’histoire sexuelle de l’humanité était un mélange d’entre eux Néandertaliens Et Dénisoviens.

En un sens, du point de vue du deep learning, c’est une preuve hypothétique d’un type de « fossile hybride » de l’adolescente identifié en 2018 ; Bien qu’il reste encore du travail à faire, les projets de recherche eux-mêmes ne sont pas directement liés.

“Notre théorie correspond à l’échantillon hybride récemment découvert à Denisova, bien que nous ne puissions pas encore exclure d’autres possibilités”, L’un des membres de l’équipe, le génomique Miuch Mondal de l’Université de Tartu en Estonie, a déclaré dans un communiqué de presse au moment de la découverte.

Cependant, les découvertes qui sont faites dans ce domaine de la science se multiplient et rapidement.

Toujours en 2018, une autre équipe de chercheurs a identifié des preuves de ce qu’ils ont appelé un “troisième événement de croisement déterminant” avec les Denisoviens et les Néandertaliens, et deux articles de recherche publiés au début de 2019 retracent la chronologie de la façon dont ces espèces éteintes se sont croisées et se sont reproduites plus clairement. détail depuis quand.

Il y a encore beaucoup de recherches à faire ici. L’application de ce type d’analyse de l’IA est certainement une nouvelle technique dans le domaine de l’origine humaine, et les preuves fossiles connues auxquelles nous avons affaire sont étonnamment rares.

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Mais selon la recherche, ce que l’équipe a trouvé n’explique pas seulement le processus oublié depuis longtemps de fouiner – ce sont les préliminaires qui informent, à leur manière, une partie de qui nous sommes aujourd’hui.

“Nous avons pensé essayer de trouver ces endroits avec une énorme différence dans le génome, voir lesquels sont des Néandertaliens et lesquels sont des Dénisoviens, puis voir si ces endroits expliquent tout le tableau”, a déclaré Bertranpetite. Smithsonian.

“En l’occurrence, si vous soustrayez les parties néandertalienne et dénisovienne, il y a toujours quelque chose dans le génome qui est très divergent.”

Les résultats ont été publiés dans Connexions naturelles.

Une version de cet article a été initialement publiée en février 2019.

Jacinthe Poulin

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