Les scientifiques identifient des anticorps qui peuvent neutraliser OMICRON et d’autres variantes de COVID

Les résultats pourraient conduire au développement de vaccins et de thérapies par anticorps plus efficaces COVID-19[feminine variables.

Une équipe internationale de scientifiques a identifié des anticorps qui neutralisent l’omicron et d’autres SRAS-CoV-2 variables. Ces anticorps ciblent des régions de la protéine squelettique du virus qui restent essentiellement inchangées lors de la mutation des virus.

En identifiant les cibles de ces anticorps « largement neutralisants » sur la protéine de pointe, il pourrait être possible de concevoir des vaccins et des thérapies par anticorps qui seront efficaces non seulement contre la variante omicron mais également contre d’autres variantes qui pourraient émerger à l’avenir, David Wessler dit, chercheur à l’Institut médical Howard Hughes et professeur agrégé de biochimie à Université de Washington Collège médical de Seattle. « Cette découverte nous dit qu’en se concentrant sur les anticorps qui ciblent ces sites hautement conservés sur la protéine de pointe, il existe un moyen de surmonter l’évolution en cours du virus », a déclaré Weissler.

Veesler a dirigé le projet de recherche avec Davide Corti de Humabs Biomed SA, Vir Biotechnology, en Suisse. Les résultats de l’étude ont été publiés le 23 décembre dans la revue tempérer la nature. Les auteurs principaux de l’étude sont Elisabetta Cameroni, Christian Saliba (HOPAS), John E. Bowen (biochimiste à l’Université de Washington) et Laura Rosen (Verre).

La variante omicron contient 37 mutations dans la protéine de pointe, qu’elle utilise pour se fixer et envahir les cellules. Il s’agit d’un nombre inhabituellement élevé de mutations. On pense que ces changements expliquent en partie pourquoi la variante est capable de se propager si rapidement, infectant les personnes vaccinées et réinfectant celles qui étaient précédemment infectées.

« Les principales questions auxquelles nous essayions de répondre étaient les suivantes : comment ce groupe de mutations dans la protéine barbelée de la variante omicron a-t-il affecté sa capacité à se lier aux cellules et à échapper aux réponses des anticorps du système immunitaire », a déclaré Wessler.

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Wessler et ses collègues spéculent qu’un grand nombre de mutations omicron peuvent s’être accumulées lors d’une infection à long terme chez une personne dont le système immunitaire est affaibli ou parce que le virus est passé de l’homme à une espèce animale et vice-versa.

Pour évaluer l’effet de ces mutations, les chercheurs ont conçu un virus désactivé et non répliqué appelé pseudovirus, pour produire des protéines de pointe à sa surface, comme le font les coronavirus. Ils ont ensuite créé des pseudovirus contenant des protéines squelettiques avec des mutations omicron et celles des premières variantes identifiées dans l’épidémie.

Les chercheurs ont d’abord cherché à déterminer dans quelle mesure différentes versions de la protéine de pointe pouvaient se lier à une protéine à la surface des cellules, que le virus utilise pour se fixer et entrer dans la cellule. Cette protéine est appelée récepteur de l’enzyme de conversion de l’angiotensine-2 (ACE2).

Ils ont découvert que la protéine de pointe de remplacement d’Omicron était capable de se lier 2,4 fois mieux que la protéine de pointe trouvée dans le virus isolé au début de l’épidémie. « Ce n’est pas une augmentation significative, mais lors de l’épidémie de SRAS de 2002-2003, des mutations dans la protéine hérissée qui augmentaient l’affinité étaient associées à une transmissibilité et à une infection plus élevées », a noté Wessler. Ils ont également découvert que le transcrit de l’omicron était capable de se lier efficacement aux récepteurs ACE2 de la souris, suggérant que l’omicron pourrait être capable de « jouer au tennis de table » entre les humains et d’autres mammifères.

Les chercheurs ont ensuite examiné dans quelle mesure les anticorps protégeaient contre les isolats précédents du virus de la variante omicron. Pour ce faire, ils ont utilisé des anticorps de patients qui avaient déjà eu des versions antérieures du virus, avaient été vaccinés contre des souches antérieures du virus ou avaient été infectés puis vaccinés.

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Ils ont découvert que les anticorps des personnes infectées par des souches antérieures et de celles qui ont reçu l’un des six vaccins les plus largement utilisés actuellement disponibles avaient une capacité réduite à prévenir l’infection.

Les anticorps de personnes précédemment infectées qui ont reçu Sputnik V ou Sinopharm plus une dose unique de Johnson & Johnson n’avaient que peu ou pas de capacité à empêcher – ou à « neutraliser » – l’entrée du variant omicron dans les cellules. Les anticorps des sujets ayant reçu deux doses des vaccins Moderna, Pfizer/BioNTech et AstraZeneca ont conservé une certaine activité neutralisante, bien que réduite de 20 à 40 fois, significativement plus que toutes les autres variables.

Les anticorps des personnes qui ont été infectées, se sont rétablies, puis ont pris deux doses du vaccin, ont également réduit leur activité, mais la diminution était moindre, environ quintuple, ce qui indique clairement que la vaccination après l’infection est bénéfique.

Les anticorps de sujets, dans ce cas un groupe de patients dialysés, qui ont reçu une dose de rappel avec une troisième dose de vaccins à ARNm produits par Moderna et Pfizer/BioNTech, ont montré une diminution de 4 fois de l’activité neutralisante. « Cela montre qu’une troisième dose est vraiment utile contre omicron », a déclaré Weissler.

Toutes les thérapies par anticorps, sauf une, actuellement autorisées ou approuvées pour une utilisation chez les patients exposés au virus, n’avaient aucune activité ou une activité significativement réduite de l’omicron in vitro. L’étude a révélé que l’exception était un anticorps appelé sotrofimab, qui avait deux à trois fois l’activité de neutralisation.

Mais lorsqu’ils ont testé un groupe plus important d’anticorps créés contre les versions précédentes du virus, les chercheurs ont identifié quatre classes d’anticorps qui conservaient leur capacité à neutraliser l’omicron. Les membres de chacune de ces classes ciblent l’une des quatre régions spécifiques de la protéine de pointe trouvée non seulement dans les variantes du SRAS-CoV-2, mais également dans un groupe de coronavirus apparentés, appelés SARP. Ces sites peuvent persister sur la protéine car ils remplissent une fonction essentielle que la protéine perdrait si elle était mutée. Ces zones sont dites « enregistrées ».

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La découverte que les anticorps sont capables de neutraliser en reconnaissant les AP dans de nombreuses variantes différentes du virus suggère que la conception de vaccins et de thérapies par anticorps qui ciblent ces régions pourrait être efficace contre un large éventail de variantes qui se manifestent par des mutations, a déclaré Fissler.

Référence: « Les anticorps neutralisants largement surmontent la transformation de l’antigène SARS-CoV-2 Omicron » Par Elisabetta Cameroni, John E. Bowen, Laura E. Rosen, Christian Saliba, Samantha K. Zbeda, Katia Kolab, Dora Pinto, Laura A. DiMarco, Julia de Julio, Fabrizia Zatta, Hana Kaiser, Julia Nowak, Nizar Farhat, Nadine Kzudnochovsky, Colin Hafnar-Dogton, Kaitlin R. Sprouse, Josh R. Dylan, Abigail E. Powell, Alex Chen, Cyrus Maher, Lee Yin, David Sun , Lea Soriaga, Jessica Passi, Chiara Celacci-Frigni, Claes Gustafson, Nicolas M. Franco, Jenny Logue, Najeha Talaat Iqbal, Ignacio Mazetelli, George Gifner, Renata Grivantini, Helen Cho, Andrea Guri, Agostino Riffini, Olivier, Alessandro Schicci, Ferrari, Pietro e Ceiba, Alessandra Franzetti-Belanda, Christian Garzoni, Peter J. Halfman, Yoshihiro Kawaka, Christy Hebner, Lisa A. Purcell, Luca Piccoli, Matteo Samuel Pezzuto, Alexandra C. Wales, Michael S. Diamond, Amal io Telenti, Herbert W. Virgin, Antonio Lanzavecchia, Gyorgy Snell, David Veesler et Davide Corti, 23 décembre 2021 Disponible tempérer la nature.
doi: 10.1038/d41586-021-03825-4

La recherche a été soutenue par le Howard Hughes Medical Institute, National Institute of Allergy and Infectious Diseases (Dp1AI158186, HHSN272201700059C, HHSN272201400008C), National Institute of General Medical Sciences (5T32GN008268-32), Rapid Grants, Pew Charitable Trusts, The Burroughs Wellcome Fund, et Centre de recherche sur la pathogenèse, la grippe (75N93021C00014), l’Agence japonaise pour la recherche et le développement médicaux (JP21wm0125002), le Pew Biomedical Scholars Award et la Fondation suisse du rein.

Jacinthe Poulin

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